元谋人的生活环境是通过共存的动植物化石来推测的 。一般将元谋人地层第三、第四段的动物化石称之为元谋动物群,认为是与元谋人共生的动物 。
与元谋人共生的哺乳动物化石,有泥河湾剑齿虎、桑氏缟鬣狗、云南马、爪蹄兽、中国犀、山西轴鹿等29种 。全部都为绝灭种,部分(38.8%)属于上新世和早更新世的残余物种,大多数为早更新世当地常见物种 。
如果然生活环境来考察,云南马等生活于草原,细麂、湖麂等生活于热带雨林,竹鼠、复齿鼠兔等动物生活于灌木丛之中,泥河湾剑齿虎等生活于森林之中 。
根据植物孢子的分析,树木主要以松属植物为多,还有榆树等 。草本植物则更多 。有人根据动物化石及植物孢粉分析,认为当时的自然环境呈森林草原景观,气候凉爽 。
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